Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPNE2Q96FN4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPNE2Q96FN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPNE2Q96FN4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms