Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MVB12AQ96EY5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MVB12AQ96EY5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MVB12AQ96EY5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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