Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHFRQ96EP1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHFRQ96EP1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHFRQ96EP1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHFRQ96EP1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms