Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF21BQ96EK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF21BQ96EK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF21BQ96EK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF21BQ96EK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms