Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C18orf8Q96DM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C18orf8Q96DM3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
C18orf8Q96DM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C18orf8Q96DM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms