Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL29Q96CT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL29Q96CT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL29Q96CT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL29Q96CT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms