Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAF2Q96CS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAF2Q96CS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAF2Q96CS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms