Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC102AQ96A19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC102AQ96A19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC102AQ96A19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC102AQ96A19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms