Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXPE3Q969Y0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NXPE3Q969Y0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXPE3Q969Y0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXPE3Q969Y0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms