Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNPO1Q92973 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TNPO1Q92973 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNPO1Q92973 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNPO1Q92973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms