Protein–RNA interactions for Protein: Q92952

KCNN1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN1Q92952 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNN1Q92952 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNN1Q92952 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNN1Q92952 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNN1Q92952 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNN1Q92952 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNN1Q92952 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNN1Q92952 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNN1Q92952 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KCNN1Q92952 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNN1Q92952 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNN1Q92952 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNN1Q92952 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNN1Q92952 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNN1Q92952 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNN1Q92952 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNN1Q92952 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNN1Q92952 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KCNN1Q92952 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNN1Q92952 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms