Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EXTL1Q92935 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXTL1Q92935 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXTL1Q92935 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXTL1Q92935 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms