Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT35Q92764 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT35Q92764 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT35Q92764 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT35Q92764 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT35Q92764 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms