Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGCDQ92629 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGCDQ92629 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCDQ92629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGCDQ92629 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGCDQ92629 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms