Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKA2Q8WVK7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKA2Q8WVK7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKA2Q8WVK7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms