Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD4Q8WVF5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD4Q8WVF5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD4Q8WVF5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms