Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 424.1■■□□□ 1.452e-9■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-209ENST00000563667 554 ntTSL 423.55■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-205ENST00000442110 691 ntTSL 523.12■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)22.96■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 AXIN1-203ENST00000457798 334 ntTSL 322.86■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-208ENST00000483939 1224 ntTSL 222.04■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 221.35■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 221.29■■□□□ 16e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-211ENST00000557299 538 ntTSL 219.33■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 319.33■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-209ENST00000495424 1679 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 319.06■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNH1-211ENST00000526295 488 ntTSL 319.01■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF274-211ENST00000615675 1259 ntTSL 218.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-211ENST00000565362 720 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ISCU-211ENST00000545932 3685 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 215.52■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNH1-221ENST00000532055 704 ntTSL 314.61□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-208ENST00000563522 556 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 KCTD20-208ENST00000483557 578 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 ME2-215ENST00000639688 4344 ntTSL 512.66□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MINDY1-204ENST00000470877 893 ntTSL 511.4□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 RNH1-220ENST00000531540 480 ntTSL 210.44□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 47.7
GEMIN5Q8TEQ6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 47.3
GEMIN5Q8TEQ6 MAPK12-202ENST00000395778 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 47.3
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-207ENST00000464190 604 ntTSL 222.01■■□□□ 1.115e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 321.85■■□□□ 1.095e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 518.76■□□□□ 0.595e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 318.74■□□□□ 0.595e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 518.74■□□□□ 0.595e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-217ENST00000529333 778 ntTSL 418.64■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-213ENST00000527470 532 ntTSL 418.64■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-220ENST00000531532 554 ntTSL 418.64■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-219ENST00000530840 531 ntTSL 518.64■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-225ENST00000629893 253 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.375e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-215ENST00000528084 535 ntTSL 417.34■□□□□ 0.375e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.245e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.73■□□□□ 0.115e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 214.08□□□□□ -0.165e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.455e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.575e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.625e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NASP-222ENST00000534101 754 ntTSL 37.96□□□□□ -1.145e-11■■■■■ 46.6
GEMIN5Q8TEQ6 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 46.3
GEMIN5Q8TEQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.162e-7■■■■■ 46.2
GEMIN5Q8TEQ6 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 230.27■■■□□ 2.442e-6■■■■■ 46.2
GEMIN5Q8TEQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.741e-6■■■■■ 46.1
GEMIN5Q8TEQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 45.7
GEMIN5Q8TEQ6 NDUFB5-215ENST00000496904 175 ntTSL 513.65□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 45.5
GEMIN5Q8TEQ6 NDUFB5-206ENST00000473500 689 ntTSL 33.54□□□□□ -1.846e-7■■■■■ 45.5
GEMIN5Q8TEQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.667e-7■■■■■ 45.3
GEMIN5Q8TEQ6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 45.3
GEMIN5Q8TEQ6 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 45.3
GEMIN5Q8TEQ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.276e-7■■■■■ 45.1
GEMIN5Q8TEQ6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.436e-7■■■■■ 45.1
GEMIN5Q8TEQ6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.426e-7■■■■■ 45.1
GEMIN5Q8TEQ6 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 44.9
GEMIN5Q8TEQ6 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 319.4■□□□□ 0.75e-12■■■■■ 44.7
GEMIN5Q8TEQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.311e-6■■■■■ 44.4
Retrieved 100 of 19,123 protein–RNA pairs in 344.8 ms