Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HAVCR2Q8TDQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HAVCR2Q8TDQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms