Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHD5Q8TDI0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHD5Q8TDI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD5Q8TDI0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD5Q8TDI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms