Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC110Q8TBZ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC110Q8TBZ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC110Q8TBZ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC110Q8TBZ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC110Q8TBZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms