Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNPRQ8TBG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNPRQ8TBG9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPRQ8TBG9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNPRQ8TBG9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms