Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMBQ8TAX9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GSDMBQ8TAX9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSDMBQ8TAX9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSDMBQ8TAX9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms