Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SVIPQ8NHG7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVIPQ8NHG7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVIPQ8NHG7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms