Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PJA1Q8NG27 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PJA1Q8NG27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PJA1Q8NG27 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PJA1Q8NG27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms