Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46DQ8NEK8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM46DQ8NEK8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46DQ8NEK8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM46DQ8NEK8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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