Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TDRD9Q8NDG6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.58■■■■■ 4.41
TDRD9Q8NDG6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TDRD9Q8NDG6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TDRD9Q8NDG6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
TDRD9Q8NDG6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
TDRD9Q8NDG6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
TDRD9Q8NDG6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms