Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC150Q8NCX0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC150Q8NCX0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC150Q8NCX0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC150Q8NCX0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC150Q8NCX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms