Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACBD4Q8NC06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACBD4Q8NC06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACBD4Q8NC06 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACBD4Q8NC06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms