Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC4A11Q8NBS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC4A11Q8NBS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC4A11Q8NBS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC4A11Q8NBS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC4A11Q8NBS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms