Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM71DQ8N9W8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM71DQ8N9W8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM71DQ8N9W8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM71DQ8N9W8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM71DQ8N9W8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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