Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIML1Q8N9V2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIML1Q8N9V2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIML1Q8N9V2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIML1Q8N9V2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIML1Q8N9V2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms