Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN22Q8N7P3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN22Q8N7P3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN22Q8N7P3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms