Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PAF1Q8N7H5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAF1Q8N7H5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAF1Q8N7H5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAF1Q8N7H5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAF1Q8N7H5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms