Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC155Q8N6L0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC155Q8N6L0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC155Q8N6L0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms