Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RYBPQ8N488 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RYBPQ8N488 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RYBPQ8N488 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RYBPQ8N488 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms