Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFRP1Q8N474 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFRP1Q8N474 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFRP1Q8N474 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms