Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3R3

TCAIM, T-cell activation inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAIMQ8N3R3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCAIMQ8N3R3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCAIMQ8N3R3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCAIMQ8N3R3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCAIMQ8N3R3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.1 ms