Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPICE1Q8N0Z3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPICE1Q8N0Z3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPICE1Q8N0Z3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms