Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN12Q8IYM2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLFN12Q8IYM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLFN12Q8IYM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLFN12Q8IYM2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLFN12Q8IYM2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLFN12Q8IYM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFN12Q8IYM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms