Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL6

FAM20C, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20CQ8IXL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20CQ8IXL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20CQ8IXL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM20CQ8IXL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM20CQ8IXL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20CQ8IXL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20CQ8IXL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM20CQ8IXL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20CQ8IXL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms