Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RASGRP3Q8IV61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGRP3Q8IV61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRP3Q8IV61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASGRP3Q8IV61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASGRP3Q8IV61 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms