Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT12Q8IV01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT12Q8IV01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYT12Q8IV01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT12Q8IV01 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms