Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC5Q8IUR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC5Q8IUR0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC5Q8IUR0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC5Q8IUR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC5Q8IUR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms