Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM50Q86XT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM50Q86XT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM50Q86XT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM50Q86XT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM50Q86XT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM50Q86XT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM50Q86XT4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM50Q86XT4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms