Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRP8Q86W28 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP8Q86W28 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP8Q86W28 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP8Q86W28 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP8Q86W28 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms