Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NLRP13Q86W25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NLRP13Q86W25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP13Q86W25 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
NLRP13Q86W25 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NLRP13Q86W25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NLRP13Q86W25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms