Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATG4DQ86TL0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG4DQ86TL0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATG4DQ86TL0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms