Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT9Q86SS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT9Q86SS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYT9Q86SS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms