Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2Q1Q7Z7E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2Q1Q7Z7E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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