Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP3Q7RTS5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP3Q7RTS5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP3Q7RTS5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms